RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-222ENST00000635152 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.98□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 BCORQ6W2J9 1755 aa14.98□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 A0A087X0B3 334 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 ANKRD7Q92527 254 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 MTMR7Q9Y216 660 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 TSPY2A6NKD2 308 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 NRDCO43847 1150 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 KIF18AQ8NI77 898 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 NARFQ9UHQ1 456 aa14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 CBFA2T2O43439 604 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 CBX1P83916 185 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 PPP2R5BQ15173 497 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 STAMQ92783 540 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 CACNA1SQ13698 1873 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 USP17L8P0C7I0 530 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 NYXQ9GZU5 481 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 INTS13Q9NVM9 706 aa14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
BRF1-222ENST00000635152 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 HOMER1Q86YM7 354 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 VSTM4Q8IW00 320 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ADAMTS3O15072 1205 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 STX17P56962 302 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 NLRP5P59047 1200 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 RPS6KA4O75676 772 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 FGRP09769 529 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CALM1P0DP23 149 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CALM2P0DP24 149 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CALM3P0DP25 149 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 MORC3Q14149 939 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 MLKLQ8NB16 471 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 MED15Q96RN5 788 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 NRAPQ86VF7 1730 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 SEMA3EO15041 775 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 PTGDRQ13258 359 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 NPY5RQ15761 445 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.94□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DDAH1O94760 285 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 TTC38Q5R3I4 469 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 COBLO75128 1261 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 MCM7P33993 719 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 KANK3Q6NY19 840 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 EP400Q96L91 3159 aa14.93□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 RREB1Q92766 1687 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 USP5P45974 858 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 TFAP4Q01664 338 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 DACH1Q9UI36 760 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ORC4O43929 436 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 SCG2P13521 617 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 TM4SF1P30408 202 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 NFIXQ14938 502 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 PAGE5Q96GU1 130 aa14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 LAMB2P55268 1798 aa14.91□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 CDC25AP30304 524 aa14.91□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 GRIK5Q16478 980 aa14.91□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
BRF1-222ENST00000635152 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms