RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 PPARAQ07869 468 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NOX5Q96PH1 765 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.12□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 USP17L21D6R901 530 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 SURF1Q15526 300 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 WDR44Q5JSH3 913 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 METTL23Q86XA0 190 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FNBP1Q96RU3 617 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MMP19Q99542 508 aa7.09□□□□□ -1.27
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