RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PAX3P23760 479 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE1AP54750 535 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RASA3Q14644 834 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RUFY1Q96T51 708 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPC6Q9Y210 931 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 KDRP35968 1356 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RASSF9O75901 435 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 STIM1Q13586 685 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP6O43182 974 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MYBPC2Q14324 1141 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 KAT14Q9H8E8 782 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SWAP70Q9UH65 585 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 COL18A1P39060 1754 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAGE8P0CG41 777 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SMIM24O75264 130 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MYL1P05976 194 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 DCAF5Q96JK2 942 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GGA2Q9UJY4 613 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SAMM50Q9Y512 469 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF4AO95239 1232 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP5JP18859 108 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC6Q86TZ1 520 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 11.2
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC23Q9UJX2 597 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 MTMR6Q9Y217 621 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC37A3O60309 1634 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNQ3O43525 872 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CUTAO60888 179 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 DESP17661 470 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 EPAS1Q99814 870 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SUN2Q9UH99 717 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PTGER2P43116 358 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 AKT1S1Q96B36 256 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 DHX58Q96C10 678 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PDLIM1O00151 329 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GJB2P29033 226 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF5BP33176 963 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RFC4P35249 363 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP8B2P98198 1209 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 DEUP1Q05D60 604 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC39A6Q13433 755 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 BCL9O00512 1426 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms