RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580004.1

NEK4P2-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 2, humanhuman

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Gene NEK4P2, Length 1,012 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P2-201ENST00000580004 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 C12orf42Q96LP6 360 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 FOXP2O15409 715 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 PDE4BQ07343 736 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 SH2D4AQ9H788 454 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 PPARAQ07869 468 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 SEPT2Q15019 361 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 C17orf99Q6UX52 265 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 FEZ1Q99689 392 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 RAD50Q92878 1312 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 AKR1B1P15121 316 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 RASA1P20936 1047 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 OSBPP22059 807 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 TREML2Q5T2D2 321 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 SMIM22K7EJ46 135 aa22.23■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 GNRH1P01148 92 aa22.23■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 VPS53Q5VIR6 699 aa22.23■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.23■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.23■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 LAMA4Q16363 1823 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 FGAP02671 866 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 BCRP11274 1271 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 NT5C2P49902 561 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 ICA1Q05084 483 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 DGKZQ13574 1117 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 KIF22Q14807 665 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 CYP2C8P10632 490 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 LPAR1Q92633 364 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 TMX2Q9Y320 296 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK4P2-201ENST00000580004 FGRP09769 529 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 ACER1Q8TDN7 264 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 MGAMO43451 1857 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 NYAP2Q9P242 653 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 CPA4Q9UI42 421 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 MYH4Q9Y623 1939 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 A0A1W2PRG0 241 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L15C9J2P7 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L11C9JVI0 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L18D6R9N7 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L22D6RA61 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L19D6RCP7 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L20D6RJB6 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 ORC4O43929 436 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 VCAM1P19320 739 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 CHMLP26374 656 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L24Q0WX57 530 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 EFCC1Q9HA90 598 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 TSPY3P0CV98 308 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 TSPY8P0CW00 308 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 PRMT2P55345 433 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 VCPKMTQ9H867 229 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 LBX2Q6XYB7 198 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 GOPCQ9HD26 462 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 TRIM17Q9Y577 477 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 PRDM1O75626 825 aa22.15■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 HERVK_113P62684 666 aa22.15■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.15■■□□□ 1.14
NEK4P2-201ENST00000580004 MKL1Q969V6 931 aa22.15■■□□□ 1.14
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