RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.07■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 CABP5Q9NP86 173 aa29.07■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.07■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.06■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.06■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 STAP2Q9UGK3 403 aa29.06■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 CCNA1P78396 465 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 MORN1Q5T089 497 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 PANK1Q8TE04 598 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 USP6NLQ92738 828 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.05■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa29.04■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.04■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 APBA2Q99767 749 aa29.04■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.04■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.03■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.03■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 SZT2Q5T011 3432 aa29.03■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 MS4A1P11836 297 aa29.02■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 VCAM1P19320 739 aa29.02■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 PLCD1P51178 756 aa29.02■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PBX1-217ENST00000559578 SHMT1P34896 483 aa29.01■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.01■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 ACER1Q8TDN7 264 aa29.01■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 NAV1Q8NEY1 1877 aa29■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 MAP2K5Q13163 448 aa29■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 CCL14Q16627 93 aa29■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 WDR78Q5VTH9 848 aa29■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 CNMDO75829 334 aa28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 PDE6AP16499 860 aa28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 LBX2Q6XYB7 198 aa28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 BMP8BP34820 402 aa28.98■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 GDF15Q99988 308 aa28.98■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 APBB1O00213 710 aa28.97■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 HMMRO75330 724 aa28.97■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 GABPAQ06546 454 aa28.97■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.97■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 GOLIM4O00461 696 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 GUCY1A2P33402 732 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 SEPT2Q15019 361 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 LHX8Q68G74 356 aa28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PBX1-217ENST00000559578 SYN1P17600 705 aa28.95■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 PTPREP23469 700 aa28.95■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 BTBD7Q9P203 1132 aa28.95■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 PFASO15067 1338 aa28.94■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 COL6A1P12109 1028 aa28.93■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.93■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 BCL11AQ9H165 835 aa28.93■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.93■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa28.92■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 ATP2B2Q01814 1243 aa28.92■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 LCORLQ8N3X6 602 aa28.92■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 LRCH3Q96II8 777 aa28.92■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.92■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 SWAP70Q9UH65 585 aa28.92■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 RAB11FIP3O75154 756 aa28.91■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 HOXC6P09630 235 aa28.91■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 GRB14Q14449 540 aa28.91■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 COG2Q14746 738 aa28.91■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.91■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 A0A1W2PRG0 241 aa28.9■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 EVX2Q03828 476 aa28.9■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.9■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.9■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 MSCO60682 206 aa28.89■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 ARMT1Q9H993 441 aa28.89■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.89■■■□□ 2.22
PBX1-217ENST00000559578 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms