RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545279.5

SMAD5-211, Transcript of SMAD family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5, Length 7,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-211ENST00000545279 GALNT17Q6IS24 598 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 RGMBQ6NW40 437 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 METTL23Q86XA0 190 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 ATP8B3O60423 1300 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 GPAA1O43292 621 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 DEXIO95424 95 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 NEDD9Q14511 834 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 FAM151AQ8WW52 585 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 USP17L12C9JPN9 530 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 USP17L21D6R901 530 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 ATP5JP18859 108 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PLCD1P51178 756 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 WDR44Q5JSH3 913 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TAF4BQ92750 862 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 GAS7O60861 476 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PRDM1O75626 825 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 ZAP70P43403 619 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PDE1AP54750 535 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 MMP19Q99542 508 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 ACAD9Q9H845 621 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 DLC1Q96QB1 1528 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 KCNQ3O43525 872 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 MSCO60682 206 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 HS1BP3Q53T59 392 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PDILTQ8N807 584 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 ALG1Q9BT22 464 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PDE6AP16499 860 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 GLTPD2A6NH11 291 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 RASA3Q14644 834 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 STXBP2Q15833 593 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TOMM70O94826 608 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 GPSM2P81274 684 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 METTL13Q8N6R0 699 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 DCAF4Q8WV16 495 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TBC1D5Q92609 795 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 LPAR1Q92633 364 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CCDC169A6NNP5 214 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 H7C1W4 665 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 DDAH1O94760 285 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 GDF11O95390 407 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 KRT10P13645 584 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 GYS1P13807 737 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 SPAG1Q07617 926 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 BFSP2Q13515 415 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 BEND3Q5T5X7 828 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TRIM17Q9Y577 477 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TTC22Q5TAA0 569 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 FAM212AQ96EL1 285 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 FIBPO43427 364 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 STAT3P40763 770 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 FSTL1Q12841 308 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 BIRC3Q13489 604 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TSPYL6Q8N831 410 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 PSMD1Q99460 953 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 STAT2P52630 851 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 KRT24Q2M2I5 525 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 USH1GQ495M9 461 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 URGCPQ8TCY9 931 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CAMTA2O94983 1202 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 SERPINC1P01008 464 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 DGKZQ13574 1117 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 CEP85Q6P2H3 762 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 RGS22Q8NE09 1264 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD5-211ENST00000545279 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms