RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530930.1

CTBP2-213, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 425 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-213	ENST00000530930	ORC4	O43929	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	RAD21	O60216	631 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	REC8	O95072	547 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ASNS	P08243	561 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	HMGCS2	P54868	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ANTXR2	P58335	489 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ICA1	Q05084	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	FEZ1	Q99689	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	FGR	P09769	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	HSPA4	P34932	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	PPIL2	Q13356	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	MOGS	Q13724	837 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	CCL15	Q16663	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	PTPN18	Q99952	460 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	PEX10	O60683	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	PPAT	Q06203	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	NOG	Q13253	232 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	ESR2	Q92731	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTBP2-213	ENST00000530930	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	PRC1	O43663	620 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	BACE1	P56817	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	KRT23	Q9C075	422 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	TNKS	O95271	1327 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	DTNB	O60941	627 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	NDUFB10	O96000	172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	CYP2C8	P10632	490 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	GTF2A2	P52657	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	TRDN	Q13061	729 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	KCNB2	Q92953	911 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	CXCL11	O14625	94 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	TTLL1	O95922	423 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	CETP	P11597	493 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	VCAM1	P19320	739 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP2-213	ENST00000530930	RXRA	P19793	462 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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