RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 PRKCZQ05513 592 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 OSBP2Q969R2 916 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 HERVK_113P62684 666 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 SEPT2Q15019 361 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 ACER1Q8TDN7 264 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 GRK4P32298 578 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 CTR9Q6PD62 1173 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 COA7Q96BR5 231 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC17Q96LX7 622 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 GABRQQ9UN88 632 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS2-204ENST00000527225 GPAA1O43292 621 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 GNAT2P19087 354 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 CDK8P49336 464 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 FSD1Q9BTV5 496 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L15C9J2P7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L11C9JVI0 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L18D6R9N7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L22D6RA61 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L19D6RCP7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L20D6RJB6 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SMIM22K7EJ46 135 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 FLT3LGP49771 235 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 USP17L24Q0WX57 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 IRF5Q13568 498 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SBK1Q52WX2 424 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 STAP2Q9UGK3 403 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 PLXNB2O15031 1838 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 M0R2C6 588 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 AKR1B1P15121 316 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 VCAM1P19320 739 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 BRCA2P51587 3418 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 A0A1W2PRG0 241 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 PDE1AP54750 535 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SMC5Q8IY18 1101 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ADCY3O60266 1144 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 UBXN2AP68543 259 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ICA1Q05084 483 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 RLFQ13129 1914 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 APPP05067 770 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ERVK-9P63128 1117 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ERVK-24P63145 666 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 MTFR1Q15390 333 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 EVI5LQ96CN4 794 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 LNPKQ9C0E8 428 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 SH2D4AQ9H788 454 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 PARP14Q460N5 1801 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS2-204ENST00000527225 MYH4Q9Y623 1939 aa20.45■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.45■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 TDO2P48775 406 aa20.45■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 LBX2Q6XYB7 198 aa20.45■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.45■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 TMX2Q9Y320 296 aa20.45■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 PEX10O60683 326 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 IGHDP01880 384 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 ELNP15502 786 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 MAPK4P31152 587 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 Q3C1V9 767 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 LPAR1Q92633 364 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.44■□□□□ 0.86
SPCS2-204ENST00000527225 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms