RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		20.77	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPF	P49454	3210 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GJB1	P08034	283 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAT2	P19087	354 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	FLT3LG	P49771	235 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		20.76	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH1	P12882	1939 aa		20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK4	P31152	587 aa		20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SBK1	Q52WX2	424 aa		20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	APPBP2	Q92624	585 aa		20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		20.75	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY3	O60266	1144 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCY1A2	P33402	732 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	FEZ1	Q99689	392 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D4A	Q9H788	454 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GJD2	Q9UKL4	321 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRQ	Q9UN88	632 aa		20.74	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L12	C9JPN9	530 aa		20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L21	D6R901	530 aa		20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA8	P48165	433 aa		20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	LPAR1	Q92633	364 aa		20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		20.73	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAB2	O43741	272 aa		20.72	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNA1	P78396	465 aa		20.72	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		20.72	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		20.72	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK8	P49336	464 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-9	P63128	1117 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-24	P63145	666 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT2	Q15019	361 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	CTR9	Q6PD62	1173 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	STAP2	Q9UGK3	403 aa		20.71	■□□□□ 0.91
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL5	P13501	91 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	VCAM1	P19320	739 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	MX1	P20591	662 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SMC5	Q8IY18	1101 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ACER1	Q8TDN7	264 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		20.7	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHD	P01880	384 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	MTFR1	Q15390	333 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBP2	Q969R2	916 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF208	Q9H0X6	261 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	TMX2	Q9Y320	296 aa		20.69	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGCR	P04035	888 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	COG2	Q14746	738 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	MB21D1	Q8N884	522 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	USP6NL	Q92738	828 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRG0	241 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SGPL1	O95470	568 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	INHA	P05111	366 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2D6	P10635	497 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	BRCA2	P51587	3418 aa		20.67	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	GPAA1	O43292	621 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ICA1	Q05084	483 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424		Q3C1V9	767 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	VCPKMT	Q9H867	229 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		20.66	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	RPTOR	Q8N122	1335 aa		20.65	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1B1	P15121	316 aa		20.65	■□□□□ 0.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		20.65	■□□□□ 0.9

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