RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	LTN1	O94822	1766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	EFS	O43281	561 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	TGFB2	P61812	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	MRC1	P22897	1456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	RREB1	Q92766	1687 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708		M0R2N6	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	MMP10	P09238	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ARAF	P10398	606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	EPX	P11678	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	GYS1	P13807	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	WEE1	P30291	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	GPR162	Q16538	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-224	ENST00000486708	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ADCY5	O95622	1261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ABL1	P00519	1130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	MCM10	Q7L590	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	FEZ1	Q99689	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	COL15A1	P39059	1388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	HOXB7	P09629	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	YY1	P25490	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	COL8A1	P27658	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ADH6	P28332	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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