RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC174Q6PII3 467 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 SMCO2A6NFE2 343 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 FLOT1O75955 427 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 CFBP00751 764 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 ANO1Q5XXA6 986 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 CTR9Q6PD62 1173 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 PSMD14O00487 310 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 STX1AQ16623 288 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 IQUBQ8NA54 791 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-211ENST00000486161 ENTPD3O75355 529 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
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PTPRD-211ENST00000486161 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
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PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.39□□□□□ -0.91
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PTPRD-211ENST00000486161 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 BIN1O00499 593 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 POLR2MP0CAP2 368 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 IL1R1P14778 569 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 AFMP43652 599 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 RCAN1P53805 252 aa9.38□□□□□ -0.91
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