RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	ERC2	O15083	957 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	FLT3LG	P49771	235 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	HERVK_113	P62684	666 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	CTR9	Q6PD62	1173 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518		M0R2C6	588 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	MTFR1	Q15390	333 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	GCC1	Q96CN9	775 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	MYH8	P13535	1937 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518		A0A1W2PRG0	241 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	AKR1B1	P15121	316 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	VCAM1	P19320	739 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	CDK8	P49336	464 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	GPAA1	O43292	621 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	USP14	P54578	494 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	COA7	Q96BR5	231 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PSME4-208	ENST00000481518	ADCY3	O60266	1144 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ELN	P15502	786 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	IRF5	Q13568	498 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	AAMP	Q13685	434 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	FSD1	Q9BTV5	496 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	BRCA2	P51587	3418 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L15	C9J2P7	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L11	C9JVI0	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L18	D6R9N7	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L22	D6RA61	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L19	D6RCP7	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L20	D6RJB6	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L24	Q0WX57	530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	STAP2	Q9UGK3	403 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518		Q3C1V9	767 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SBK1	Q52WX2	424 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	PLXNB2	O15031	1838 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	PDE1A	P54750	535 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SMC5	Q8IY18	1101 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC17	Q96LX7	622 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	CNMD	O75829	334 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	IGHD	P01880	384 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	CCL5	P13501	91 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ERVK-9	P63128	1117 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ERVK-24	P63145	666 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ICA1	Q05084	483 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	LNPK	Q9C0E8	428 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	PORCN	Q9H237	461 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SHISA4	Q96DD7	197 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PSME4-208	ENST00000481518	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	INHA	P05111	366 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	GNAT2	P19087	354 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	UBXN2A	P68543	259 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	TMX2	Q9Y320	296 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	TDO2	P48775	406 aa		27.56	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		27.56	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	APP	P05067	770 aa		27.55	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	RASA1	P20936	1047 aa		27.55	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		27.55	■■■□□ 2
PSME4-208	ENST00000481518	LBX2	Q6XYB7	198 aa		27.55	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms