RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
OPN3-204ENST00000469376 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.63■■■□□ 2.33
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OPN3-204ENST00000469376 FANCLQ9NW38 375 aa29.63■■■□□ 2.33
OPN3-204ENST00000469376 KCNJ14Q9UNX9 436 aa29.63■■■□□ 2.33
OPN3-204ENST00000469376 BCAMP50895 628 aa29.63■■■□□ 2.33
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OPN3-204ENST00000469376 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.63■■■□□ 2.33
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OPN3-204ENST00000469376 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.63■■■□□ 2.33
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OPN3-204ENST00000469376 SEC23AQ15436 765 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 SPECC1Q5M775 1068 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CCDC34Q96HJ3 373 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 PARP3Q9Y6F1 533 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP6O43182 974 aa29.57■■■□□ 2.32
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OPN3-204ENST00000469376 SPATA20Q8TB22 786 aa29.55■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 V9GYY5 206 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 PRR29P0C7W0 189 aa29.54■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 REXO1L1PQ8IX06 675 aa29.54■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa29.54■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 BMP15O95972 392 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 TMEM139Q8IV31 216 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CCDC82Q8N4S0 544 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CASZ1Q86V15 1759 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 TRIM75PA6NK02 468 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 TRIM65Q6PJ69 517 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 OXER1Q8TDS5 423 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CABP5Q9NP86 173 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 PLCD1P51178 756 aa29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 MYH6P13533 1939 aa29.52■■■□□ 2.32
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OPN3-204ENST00000469376 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 KRT2P35908 639 aa29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.322e-7■■■■□ 20.9
OPN3-204ENST00000469376 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 CSRNP2Q9H175 543 aa29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 DNAI1Q9UI46 699 aa29.52■■■□□ 2.32
OPN3-204ENST00000469376 STX10O60499 249 aa29.51■■■□□ 2.31
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