RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 ZMYM6O95789 1325 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CETPP11597 493 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TFAP4Q01664 338 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP2B2Q01814 1243 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 STOX1Q6ZVD7 989 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR18Q9BV38 432 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CABP5Q9NP86 173 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TOMM22Q9NS69 142 aa13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CXCL11O14625 94 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF213O14771 459 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 PEX10O60683 326 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP21A2P08686 494 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 FGRP09769 529 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP2C8P10632 490 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 BACE1P56817 501 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SREBF2Q12772 1141 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP4K1Q92918 833 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP95Q96GE4 821 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.07□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 B4E1Z4 1266 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 PDHXO00330 501 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ORC4O43929 436 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ICA1Q05084 483 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 PDE4BQ07343 736 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CRHR2Q13324 411 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 RASGRP2Q7LDG7 609 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC17Q96LX7 622 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 FEZ1Q99689 392 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.06□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 USP17L10C9JJH3 530 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPY3P0CV98 308 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPY8P0CW00 308 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 LBX1P52954 281 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CAP1Q01518 475 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 GINM1Q9NU53 330 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 MYH4Q9Y623 1939 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.05□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPY2A6NKD2 308 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC27A2O14975 620 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM4AO75164 1064 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 INHBEP58166 350 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CHST3Q7LGC8 479 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD23Q86SG2 305 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 RASEFQ8IZ41 740 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.04□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 E7EWF7 191 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 RAD21O60216 631 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SEC24BO95487 1268 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 NECTIN1Q15223 517 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CASC1Q6TDU7 716 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 ZSWIM5Q9P217 1185 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 CPA4Q9UI42 421 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 MTMR7Q9Y216 660 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TMX2Q9Y320 296 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 PLIN4Q96Q06 1357 aa13.03□□□□□ -0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 C19orf81C9J6K1 198 aa13.02□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 CA12O43570 354 aa13.02□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 VCAM1P19320 739 aa13.02□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 RCSD1Q6JBY9 416 aa13.02□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RPRD1B-202ENST00000449186 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms