RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PRG0 241 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CAP1Q01518 475 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 SP3Q02447 781 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 PPARAQ07869 468 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 C17orf99Q6UX52 265 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 FGAP02671 866 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 IL25Q9H293 177 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CPA4Q9UI42 421 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 PRDM1O75626 825 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 C12orf42Q96LP6 360 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 FEZ1Q99689 392 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ICA1Q05084 483 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ZMYM6O95789 1325 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 MYH8P13535 1937 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 BCRP11274 1271 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 CHMLP26374 656 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 USP14P54578 494 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ERO1AQ96HE7 468 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 INCENPQ9NQS7 918 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 PNMA3Q9UL41 463 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-206ENST00000443528 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.593e-23■■□□□ 14.2
ACTB-206ENST00000443528 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 OSBPP22059 807 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 PDE4BQ07343 736 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 TMX2Q9Y320 296 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 VCAM1P19320 739 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 FGRP09769 529 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 CTGFP29279 349 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 NBPF3Q9H094 633 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 TRIM17Q9Y577 477 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 HAND2P61296 217 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 TFAP4Q01664 338 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 VCPKMTQ9H867 229 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 EFCC1Q9HA90 598 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 NYAP2Q9P242 653 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 RAD50Q92878 1312 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L15C9J2P7 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L11C9JVI0 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L18D6R9N7 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L22D6RA61 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L19D6RCP7 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L20D6RJB6 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ORC4O43929 436 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 HERVK_113P62684 666 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ATP2B2Q01814 1243 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 USP17L24Q0WX57 530 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 CEP95Q96GE4 821 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 ABHD8Q96I13 439 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
ACTB-206ENST00000443528 SH2D4AQ9H788 454 aa18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms