RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ERO1AQ96HE7 468 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 PTPRFP10586 1907 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 C17orf99Q6UX52 265 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 PNMA3Q9UL41 463 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 RASA1P20936 1047 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 USP14P54578 494 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ALX1Q15699 326 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 PRDM1O75626 825 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 OSBPP22059 807 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ICA1Q05084 483 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 SKAP1Q86WV1 359 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PRG0 241 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 FGAP02671 866 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 PDE4BQ07343 736 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 C12orf42Q96LP6 360 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HERC3-205ENST00000426683 BCRP11274 1271 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 TRIM17Q9Y577 477 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 CAP1Q01518 475 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 KIF22Q14807 665 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ZMYM6O95789 1325 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 VCAM1P19320 739 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ATP2B2Q01814 1243 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 SH2D4AQ9H788 454 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 EFCC1Q9HA90 598 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 TMX2Q9Y320 296 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 MYH8P13535 1937 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 CHMLP26374 656 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF6Q15052 776 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ABHD8Q96I13 439 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 IL25Q9H293 177 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 INCENPQ9NQS7 918 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L15C9J2P7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L11C9JVI0 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L18D6R9N7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L22D6RA61 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L19D6RCP7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L20D6RJB6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 TSPY3P0CV98 308 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 TSPY8P0CW00 308 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 HAND2P61296 217 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 USP17L24Q0WX57 530 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 RAD50Q92878 1312 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 TFAP4Q01664 338 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-205ENST00000426683 CTGFP29279 349 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PSMC4P43686 418 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 HERVK_113P62684 666 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 LPAR1Q92633 364 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 VCPKMTQ9H867 229 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 NYAP2Q9P242 653 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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