RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 ERICH2A1L162 156 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP5-203ENST00000408919 CHADLQ6NUI6 762 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP5-203ENST00000408919 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP5-203ENST00000408919 MOB2Q70IA6 237 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP5-203ENST00000408919 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP5-203ENST00000408919 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 NOVP48745 357 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 STX8Q9UNK0 236 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 YY1P25490 414 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 EVCP57679 992 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD1Q15327 319 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 IL27Q8NEV9 243 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ME3Q16798 604 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 DGKHQ86XP1 1220 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKS1AQ92625 1134 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 MYL10Q9BUA6 226 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CABP5Q9NP86 173 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 NF2P35240 595 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 TMX3Q96JJ7 454 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ASNSP08243 561 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 MCM2P49736 904 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ICA1Q05084 483 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 APOA5Q6Q788 366 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 HSCBQ8IWL3 235 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 TTLL1O95922 423 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 RXRAP19793 462 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC69A6NI79 296 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC4A3P48751 1232 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP2B2Q01814 1243 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ST3GAL1Q11201 340 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 STK3Q13188 491 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 TMTC2Q8N394 836 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 NECAB1Q8N987 351 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A1W2PRG0 241 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 VGLL4Q14135 290 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 MICU3Q86XE3 530 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K9P80192 1104 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K11Q16584 847 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 PNMA1Q8ND90 353 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ACER1Q8TDN7 264 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 KAT14Q9H8E8 782 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 NYAP2Q9P242 653 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP5-203ENST00000408919 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 DTNBO60941 627 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 ECE1P42892 770 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 TROAPQ12815 778 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 MTMR7Q9Y216 660 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 CST9Q5W186 159 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 MKL1Q969V6 931 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRFP10586 1907 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB43O43298 467 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRAP18433 802 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 SCRN1Q12765 414 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP5-203ENST00000408919 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms