RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LAMC1P11047 1609 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V1AP38606 617 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PHKBQ93100 1093 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 HINFPQ9BQA5 517 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CUTAO60888 179 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CRCPO75575 148 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PLCG2P16885 1265 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ATP11AP98196 1134 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PTH1RQ03431 593 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PDE4DQ08499 809 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM14Q14142 442 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 A1BGP04217 495 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 STMN1P16949 149 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 GNGT1P63211 74 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM87BQ96K49 555 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 USP28Q96RU2 1077 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MYL10Q9BUA6 226 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MGEA5O60502 916 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CA8P35219 290 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PNOCQ13519 176 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 VSIG1Q86XK7 387 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 XAGE2Q96GT9 111 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CEP104O60308 925 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ATP1A2P50993 1020 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 OGFOD1Q8N543 542 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP3Q96P20 1036 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PAK1Q13153 545 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CUL4AQ13619 759 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KRT40Q6A162 431 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TRPC3Q13507 836 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 POSTNQ15063 836 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 LETM2Q2VYF4 491 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KIFAP3Q92845 792 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RTL9Q8NET4 1388 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 STX10O60499 249 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 GNA11P29992 359 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ST5P78524 1137 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SATB1Q01826 763 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KRT71Q3SY84 523 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TTC16Q8NEE8 873 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NOX5Q96PH1 765 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ITGA6P23229 1130 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PAK2Q13177 524 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 LGSNQ5TDP6 509 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NGLY1Q96IV0 654 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0D9SFI3 127 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 GPAA1O43292 621 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DDB1Q16531 1140 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS7Q99871 368 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP1Q9C000 1473 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MBD4O95243 580 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PLS1Q14651 629 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PHKG2P15735 406 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GUCY2FP51841 1108 aa9.84□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms