RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa34.8■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa34.8■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM88BA6NKF7 163 aa34.79■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 RPS6KB1P23443 525 aa34.79■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 UBAC1Q9BSL1 405 aa34.79■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 ELP3Q9H9T3 547 aa34.79■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 UNCXA6NJT0 531 aa34.78■■■■□ 3.16
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ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 KANSL2Q9H9L4 492 aa34.78■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 PHIPQ8WWQ0 1821 aa34.78■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 HUNKP57058 714 aa34.77■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC2Q9BYS8 371 aa34.77■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 MTMR4Q9NYA4 1195 aa34.77■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 TNKSO95271 1327 aa34.77■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 SAPCD2Q86UD0 394 aa34.77■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 WDR19Q8NEZ3 1342 aa34.76■■■■□ 3.16
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ECHS1-201ENST00000368547 STX8Q9UNK0 236 aa34.75■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC10A4Q96EP9 437 aa34.74■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM87BQ96K49 555 aa34.74■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D2Q9BYX2 928 aa34.74■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 ZHX2Q9Y6X8 837 aa34.74■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 ERICH2A1L162 156 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 ATP2B2Q01814 1243 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC178Q5BJE1 867 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM67Q5HYA8 995 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 SIAH1Q8IUQ4 282 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 MTA3Q9BTC8 594 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL1O95922 423 aa34.73■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 SEC23AQ15436 765 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 RCSD1Q6JBY9 416 aa34.73■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 ERO1BQ86YB8 467 aa34.73■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 SPDYE5A6NIY4 337 aa34.72■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 NEK4P51957 841 aa34.72■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 PDRG1Q9NUG6 133 aa34.72■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 NYAP2Q9P242 653 aa34.72■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 CLIP2Q9UDT6 1046 aa34.72■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 NOVP48745 357 aa34.71■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa34.71■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZUG5 572 aa34.71■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 HSCBQ8IWL3 235 aa34.71■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 ACER1Q8TDN7 264 aa34.7■■■■□ 3.15
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ECHS1-201ENST00000368547 AS3MTQ9HBK9 375 aa34.7■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa34.7■■■■□ 3.15
ECHS1-201ENST00000368547 ST18O60284 1047 aa34.7■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 PPATQ06203 517 aa34.7■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 LY9Q9HBG7 655 aa34.7■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 SENP2Q9HC62 589 aa34.7■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PRG0 241 aa34.69■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 ECE1P42892 770 aa34.69■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
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ECHS1-201ENST00000368547 WDR18Q9BV38 432 aa34.69■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 SPP2Q13103 211 aa34.68■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF280CQ8ND82 737 aa34.68■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM47Q9BQJ4 181 aa34.68■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 CREBZFQ9NS37 354 aa34.68■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa34.68■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM75PA6NK02 468 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 RGMBQ6NW40 437 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 MKL1Q969V6 931 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 TOP1P11387 765 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 LIFRP42702 1097 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 PPIL2Q13356 520 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 FEZ1Q99689 392 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 TMX2Q9Y320 296 aa34.66■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 IRF6O14896 467 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 GJA5P36382 358 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL16Q8N461 479 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 BRF1Q92994 677 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 WNK4Q96J92 1243 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 AGXT2Q9BYV1 514 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 KAT14Q9H8E8 782 aa34.65■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRFP10586 1907 aa34.64■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L10C9JJH3 530 aa34.64■■■■□ 3.14
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