RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 GINM1Q9NU53 330 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPINK2P20155 84 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIK1P39086 918 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARSHQ5FYA8 562 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 GMIPQ9P107 970 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPT2Q9UMR5 302 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR33A8MZF0 331 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAMTS4O75173 837 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX9P48436 509 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 MLECQ14165 292 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTX1Q86Y01 620 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATG4CQ96DT6 458 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF2CQ99661 725 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGS13O14921 159 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAX4O43316 350 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBOX5O94941 541 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEACAM5P06731 702 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITIH2P19823 946 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 NETO1Q8TDF5 533 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPATA32Q96LK8 384 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 TINF2Q9BSI4 451 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFRSF10CO14798 259 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBX7O95931 251 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRNPP04156 253 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAG1P15918 1043 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.22□□□□□ -1.73
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RNU6-227P-201ENST00000362865 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
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RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPN10Q9HC96 672 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
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RNU6-227P-201ENST00000362865 IMPDH2P12268 514 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP7A1P22680 504 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 GBP1P32455 592 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 ETV3P41162 512 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 BNIP3Q12983 259 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD4AQ8N468 514 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 VWCEQ96DN2 955 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC9A7Q96T83 725 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD96P40200 585 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIR3DL1P43629 444 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 GIPRP48546 466 aa4.2□□□□□ -1.74
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