RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 TUBB4AP04350 444 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 IQCA1Q86XH1 822 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 COA1Q9GZY4 146 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 KIF28PB7ZC32 967 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 BTDP43251 543 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 LRMPQ12912 555 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 C12orf60Q5U649 245 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 BRAPQ7Z569 592 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 PDE4BQ07343 736 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 KRT40Q6A162 431 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 FANCBQ8NB91 859 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2IP78347 998 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 PTPN14Q15678 1187 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF11Q86T75 865 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CERS3Q8IU89 383 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 BICD2Q8TD16 824 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 GAKO14976 1311 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF165P49910 485 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 SLF2Q8IX21 1173 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 WASF1Q92558 559 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TULP2O00295 520 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 GUCY1A2P33402 732 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM29Q14134 588 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 PPP2R5BQ15173 497 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 STYK1Q6J9G0 422 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TEX11Q8IYF3 940 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DACT1Q9NYF0 836 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CTAGE5O15320 804 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 NMT2O60551 498 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 H0YIN7 160 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DDAH1O94760 285 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 PLCG2P16885 1265 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 RHBDL3P58872 404 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DOK7Q18PE1 504 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 FBXW7Q969H0 707 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CLIC4Q9Y696 253 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY2A6NKD2 308 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DEXIO95424 95 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 NT5C2P49902 561 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TROAPQ12815 778 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 NR1I2O75469 434 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CALM1P0DP23 149 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CALM2P0DP24 149 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CALM3P0DP25 149 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 PDE4CQ08493 712 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CERS5Q8N5B7 392 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 EYA3Q99504 573 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 YEATS4O95619 227 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 KCNJ6P48051 423 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms