RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CPLX1O14810 134 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 DDAH1O94760 285 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 C1QTNF8P60827 252 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 MICU3Q86XE3 530 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP95Q96GE4 821 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SLURP2P0DP57 97 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 NOVP48745 357 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ST3GAL1Q11201 340 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 DCAF15Q66K64 600 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 FANCBQ8NB91 859 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR90Q96KV7 1748 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 TTLL1O95922 423 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SULF1Q8IWU6 871 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CDKL5O76039 1030 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 TOMM70O94826 608 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RTN1Q16799 776 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 PNMA1Q8ND90 353 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 MYL10Q9BUA6 226 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 TROAPQ12815 778 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K14Q99558 947 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NID2Q14112 1375 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 GDF11O95390 407 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RXRAP19793 462 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 DDIT3P35638 169 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF3AQ9Y496 699 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 POTECB2RU33 542 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 GH2P01242 217 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 GJB2P29033 226 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF5BP33176 963 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 GINM1Q9NU53 330 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NYAP2Q9P242 653 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CAP2P40123 477 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SEPT2Q15019 361 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RRAGCQ9HB90 399 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CTDNEP1O95476 244 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 PDCP20941 246 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CDC27P30260 824 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NUCB2P80303 420 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP2B2Q01814 1243 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 MKL1Q969V6 931 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SCN4AP35499 1836 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SIPA1L1O43166 1804 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 JAK2O60674 1132 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 ASNSP08243 561 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 GNAQP50148 359 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 ICA1Q05084 483 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 IFNAR1P17181 557 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 GUCY1A2P33402 732 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX11Q96FC9 970 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 GRM4Q14833 912 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM2B-201ENST00000335523 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms