RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038889.11

Ttll3-202, Transcript of Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Ttll3, Length 3,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Hps6Q8BLY7 805 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ttc12Q8BW49 704 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ubac1Q8VDI7 409 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 AmfrQ9R049 643 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Zfand4D3Z3C6 739 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 TbcaP48428 108 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Slc38a10Q5I012 1090 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Jmjd4Q8BFT6 427 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Krt222Q8CCX5 294 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Card14Q99KF0 999 aa17.3■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Wnt7aP24383 349 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Otop3Q80UF9 577 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Srgap2Q91Z67 1071 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fam217aQ9D9W6 419 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Setdb1O88974 1307 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Chp1P61022 195 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Pde4dQ01063 747 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Slc20a2Q80UP8 656 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Znf771Q8BJ90 317 aa17.29■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Nkx2-5P42582 318 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Txndc5Q91W90 417 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Pcdha12Q91Y18 950 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ccdc96Q9CR92 584 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Plbd2Q3TCN2 594 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Dnph1Q80VJ3 173 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Lama4P97927 1816 aa17.28■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Prr5lA2AVJ5 370 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Myl3P09542 204 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tdo2P48776 406 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cnnm2Q3TWN3 875 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Slc44a1Q6X893 653 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Lmbr1Q9JIT0 490 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Mroh6V9GX81 722 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Myh2G3UW82 1942 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 A0A1Y7VML8 143 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fchsd1Q6PFY1 688 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa17.27■□□□□ 0.36
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kndc1Q0KK55 1742 aa17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Top1Q04750 767 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tacc1Q6Y685 774 aa17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kif2bQ8C0N1 668 aa17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rasal3Q8C2K5 1041 aa17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Vps53Q8CCB4 832 aa17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Dpf1Q9QX66 387 aa17.27■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Trim30cD3YVI9 513 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gpr108Q91WD0 569 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Itga2bQ9QUM0 1033 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cfap44E9Q5M6 1843 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gm28042B7ZCM9 1014 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rexo5D3YW29 759 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ckap2Q3V1H1 664 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tmem232Q5K6N0 675 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Terb1Q8C0V1 768 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ccdc83Q9D4V3 305 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 FAM186AQ9D9R9 1790 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Mast2Q60592 1734 aa17.26■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 4932429P05RikA2ADI4 785 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cnga2Q62398 664 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Eif3j2Q66JS6 263 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Epn1Q80VP1 575 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Susd4Q8BH32 490 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gga3Q8BMI3 718 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Znf131Q8K3J5 619 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Foxo3Q9WVH4 672 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Dennd3A2RT67 1274 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cct5P80316 541 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tcp11Q01755 566 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gjb4Q02738 266 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 MycbpapQ5SUV2 932 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Brms1Q99N20 246 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Plekho1Q9JIY0 408 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Uchl5Q9WUP7 329 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kifc2O08672 792 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cdr2P97817 455 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kiaa1468Q148V7 1216 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Exoc5Q3TPX4 708 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tube1Q9D6T1 475 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Copb1Q9JIF7 953 aa17.25■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa17.24■□□□□ 0.35
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Palm3A2TJV2 734 aa17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.3 ms