RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ncam2	O35136	837 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clk1	P22518	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atxn1	P54254	791 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Six5	P70178	719 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	G3bp1	P97855	465 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankmy2	Q3TPE9	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptprn	Q60673	979 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt9	Q6RHW0	743 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clba1	Q8BHN9	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpr150	Q8BL07	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Samd3	Q8C4H2	520 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rec8	Q8C5S7	591 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Phc3	Q8CHP6	981 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plcg2	Q8CIH5	1265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ago4	Q8CJF8	861 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Unc5d	Q8K1S2	956 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp26	Q99MX1	835 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bap1	Q99PU7	728 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nkiras2	Q9CR56	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Snx5	Q9D8U8	404 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jmjd6	Q9ERI5	403 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sfmbt1	Q9JMD1	863 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ambra1	A2AH22	1300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptprk	P35822	1457 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hoxb3	P09026	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnm1	P39053	867 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbp3	P49194	1234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbx3	P70324	741 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anp32e	P97822	260 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aplp1	Q03157	653 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Axdnd1	Q3UZ57	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	MENT	Q569E4	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Phf12	Q5SPL2	1003 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rrp12	Q6P5B0	1295 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erc2	Q6PH08	957 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sgta	Q8BJU0	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmc7	Q8C428	726 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prr33	Q8C494	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbx22	Q8K402	517 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1090	Q8VGA6	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Asic2	Q925H0	512 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d20	Q9D9I4	402 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hip1r	Q9JKY5	1068 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009		A0A286YDG0	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Veph1	A1A535	833 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10376	D3YXI8	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3543	D3Z235	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3893	E9Q1I1	302 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm4181	E9Q7X3	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10375	L7N286	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3573	L7N292	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif6	O55135	245 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grk6	O70293	576 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anxa6	P14824	673 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slmap	Q3URD3	845 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim75	Q3UWZ0	467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dzip1l	Q499E4	774 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nfe2l1	Q61985	741 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Samm50	Q8BGH2	469 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map4k5	Q8BPM2	847 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il23r	Q8K4B4	644 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cnot6l	Q8VEG6	555 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Actrt2	Q9D9L5	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700001F09Rik	Q9DAR5	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rsc1a1	Q9ER99	582 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scube2	Q9JJS0	997 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map3k14	Q9WUL6	942 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Elp1	Q7TT37	1333 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pbrm1	Q8BSQ9	1634 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbbp8nl	A2ABX0	614 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Izumo3	A6PWV3	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700031F05Rik	B1AX30	191 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm5861	F6VCN9	180 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map7	O88735	730 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Whamm	Q571B6	793 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pced1a	Q6P1Z5	449 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf513	Q6PD29	541 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slitrk4	Q810B8	837 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnv1	Q8BZN2	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iws1	Q8C1D8	766 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp20	Q8C6M1	916 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spats2	Q8K1N4	545 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem119	Q8R138	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rhov	Q8VDU1	236 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr351	Q8VGK1	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zkscan3	Q91VW9	553 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fcf1	Q9CTH6	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep89	Q9CZX2	791 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam162a	Q9D6U8	155 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clstn2	Q9ER65	966 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rilpl1	Q9JJC6	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Actr10	Q9QZB7	417 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapk9	Q9WTU6	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Heph	Q9Z0Z4	1157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ncapd2	Q8K2Z4	1392 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pogz	Q8BZH4	1409 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igha	A0A0A6YXW6	389 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm5580	A0A0N4SVP8	411 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clip3	B9EHT4	547 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ces1h	D3Z298	562 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 267.5 ms