RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa7.97□□□□□ -1.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1lQ9D1G7 135 aa7.95□□□□□ -1.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2gO70558 76 aa7.85□□□□□ -1.15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2dO70555 85 aa7.83□□□□□ -1.16
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1Y7VJH8 109 aa7.82□□□□□ -1.16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1eQ9D139 143 aa7.79□□□□□ -1.16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1kJ3QP15 125 aa7.75□□□□□ -1.17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2iO70560 76 aa7.69□□□□□ -1.18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1cQ9D1C5 147 aa7.69□□□□□ -1.18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa7.67□□□□□ -1.18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa7.59□□□□□ -1.19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap19-4Q925H7 84 aa7.56□□□□□ -1.2
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm11568A2A4M2 211 aa7.54□□□□□ -1.2
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap9-1Q64526 186 aa7.54□□□□□ -1.2
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1fB9EJP6 147 aa7.5□□□□□ -1.21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce3cQ91V05 98 aa7.5□□□□□ -1.21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce1a1Q9CQH5 143 aa7.46□□□□□ -1.22
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mt1P02802 61 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce3dE9Q8V1 98 aa7.36□□□□□ -1.23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce3eF8VQJ0 98 aa7.34□□□□□ -1.23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce3fQ6PAI4 98 aa7.34□□□□□ -1.23
Odc1-201ENSMUST00000171737 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa7.27□□□□□ -1.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10100J3QK64 120 aa7.2□□□□□ -1.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa7.1□□□□□ -1.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm11559Q9D3H7 191 aa7.1□□□□□ -1.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa7.07□□□□□ -1.28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lce3aQ497I5 98 aa7.02□□□□□ -1.29
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10142J3KMP7 120 aa6.99□□□□□ -1.29
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa6.93□□□□□ -1.3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm11554B1AQB2 190 aa6.89□□□□□ -1.31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm2431E9Q8S1 172 aa6.87□□□□□ -1.31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2hO70559 108 aa6.81□□□□□ -1.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hmcn1D3YXG0 5634 aa6.78□□□□□ -1.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa6.71□□□□□ -1.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa6.71□□□□□ -1.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap5-5Q2TA51 241 aa6.71□□□□□ -1.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap5-4Q62220 223 aa6.71□□□□□ -1.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mt3P28184 68 aa6.66□□□□□ -1.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm9112A2AI92 75 aa6.66□□□□□ -1.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa6.64□□□□□ -1.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1Y7VLE6 161 aa6.61□□□□□ -1.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa6.6□□□□□ -1.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eppk1Q8R0W0 6548 aa6.37□□□□□ -1.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa6.35□□□□□ -1.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2eO70556 76 aa6.31□□□□□ -1.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Muc19Q6PZE0 7524 aa6.17□□□□□ -1.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa6.01□□□□□ -1.45
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap31-1Q9D644 177 aa5.97□□□□□ -1.45
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa5.93□□□□□ -1.46
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2fO70557 76 aa5.76□□□□□ -1.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa5.64□□□□□ -1.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Muc16A0A140LJ72 8478 aa5.63□□□□□ -1.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 NebE9Q1W3 7152 aa5.62□□□□□ -1.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap4-16Q91W93 202 aa5.56□□□□□ -1.52
Odc1-201ENSMUST00000171737 1110025L11RikO09048 78 aa5.53□□□□□ -1.52
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap6-5Q925H3 78 aa5.53□□□□□ -1.52
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1Y7VJ07 166 aa5.43□□□□□ -1.54
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa5.01□□□□□ -1.61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm11567Q9D141 195 aa4.95□□□□□ -1.62
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10229O08631 77 aa4.92□□□□□ -1.62
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sprr2bO70554 98 aa4.64□□□□□ -1.67
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap21-1Q925H4 128 aa4.52□□□□□ -1.69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap6-2O08884 159 aa4.25□□□□□ -1.73
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A286YCP9 139 aa4.24□□□□□ -1.73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Phgr1Q8K0G7 91 aa4.06□□□□□ -1.76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa3.86□□□□□ -1.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa3.85□□□□□ -1.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa3.85□□□□□ -1.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa3.82□□□□□ -1.8
Odc1-201ENSMUST00000171737 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa3.56□□□□□ -1.84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa3.46□□□□□ -1.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa3.42□□□□□ -1.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krtap5-1Q64507 230 aa3.38□□□□□ -1.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm4559A4IF42 199 aa2.89□□□□□ -1.95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 80 of 22,080 RNA–protein pairs in 120.6 ms