RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap4-8B1AQA8 209 aa7.18□□□□□ -1.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm10142J3KMP7 120 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap4-7Q9D732 168 aa7.05□□□□□ -1.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A0A1Y7VLE6 161 aa7.01□□□□□ -1.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sprr2iO70560 76 aa6.96□□□□□ -1.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Syne1Q6ZWR6 8799 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap4-9B1AQA9 244 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce3cQ91V05 98 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fsip2A2ARZ3 6995 aa6.91□□□□□ -1.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sprr2hO70559 108 aa6.9□□□□□ -1.3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce3dE9Q8V1 98 aa6.89□□□□□ -1.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa6.79□□□□□ -1.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sprr2eO70556 76 aa6.77□□□□□ -1.32
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mt4P47945 62 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce3eF8VQJ0 98 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce3fQ6PAI4 98 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sprr2kO70562 68 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 2300003K06RikA2A4M0 262 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce3aQ497I5 98 aa6.62□□□□□ -1.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sprr2fO70557 76 aa6.61□□□□□ -1.35
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa6.55□□□□□ -1.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa6.53□□□□□ -1.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce1lQ9D1G7 135 aa6.47□□□□□ -1.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap31-1Q9D644 177 aa6.47□□□□□ -1.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce1bQ9D149 137 aa6.46□□□□□ -1.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mt1P02802 61 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa6.21□□□□□ -1.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa6.2□□□□□ -1.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lce1kJ3QP15 125 aa6.2□□□□□ -1.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap4-16Q91W93 202 aa6.13□□□□□ -1.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A0A1Y7VJ07 166 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eppk1Q8R0W0 6548 aa6.08□□□□□ -1.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm11568A2A4M2 211 aa5.95□□□□□ -1.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap9-1Q64526 186 aa5.95□□□□□ -1.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa5.89□□□□□ -1.47
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa5.79□□□□□ -1.48
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa5.72□□□□□ -1.49
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa5.67□□□□□ -1.5
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa5.63□□□□□ -1.51
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm11559Q9D3H7 191 aa5.6□□□□□ -1.51
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mt3P28184 68 aa5.56□□□□□ -1.52
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa5.54□□□□□ -1.52
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm11554B1AQB2 190 aa5.51□□□□□ -1.53
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa5.46□□□□□ -1.54
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa5.39□□□□□ -1.55
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Muc19Q6PZE0 7524 aa5.31□□□□□ -1.56
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa5.25□□□□□ -1.57
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm2431E9Q8S1 172 aa5.23□□□□□ -1.57
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa5.21□□□□□ -1.57
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hmcn1D3YXG0 5634 aa5.19□□□□□ -1.58
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Muc16A0A140LJ72 8478 aa5.17□□□□□ -1.58
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap5-5Q2TA51 241 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap5-4Q62220 223 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccsap-201ENSMUST00000034452 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa4.94□□□□□ -1.62
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NebE9Q1W3 7152 aa4.93□□□□□ -1.62
Ccsap-201ENSMUST00000034452 A0A286YCP9 139 aa4.92□□□□□ -1.62
Ccsap-201ENSMUST00000034452 1110025L11RikO09048 78 aa4.92□□□□□ -1.62
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap6-5Q925H3 78 aa4.92□□□□□ -1.62
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa4.72□□□□□ -1.65
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4.69□□□□□ -1.66
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sprr2bO70554 98 aa4.62□□□□□ -1.67
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm10229O08631 77 aa4.33□□□□□ -1.72
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Phgr1Q8K0G7 91 aa4.06□□□□□ -1.76
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap21-1Q925H4 128 aa4.06□□□□□ -1.76
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm11567Q9D141 195 aa4.04□□□□□ -1.76
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa3.88□□□□□ -1.79
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap6-2O08884 159 aa3.61□□□□□ -1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Krtap5-1Q64507 230 aa2.96□□□□□ -1.94
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm4559A4IF42 199 aa2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 80 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.5 ms