RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11555B1AQ89 175 aa5.12□□□□□ -1.59
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lce3fQ6PAI4 98 aa5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11596B1AQB0 205 aa5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr2eO70556 76 aa5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2300003K06RikA2A4M0 262 aa5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mt4P47945 62 aa4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lce3aQ497I5 98 aa4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11564A2A4L9 201 aa4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11563B1AQ90 168 aa4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11595B1AQA7 289 aa4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap4-8B1AQA8 209 aa4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lce1bQ9D149 137 aa4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr2fO70557 76 aa4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap31-1Q9D644 177 aa4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr2kO70562 68 aa4.88□□□□□ -1.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap4-9B1AQA9 244 aa4.86□□□□□ -1.63
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fsip2A2ARZ3 6995 aa4.82□□□□□ -1.64
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lce1lQ9D1G7 135 aa4.73□□□□□ -1.65
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap4-16Q91W93 202 aa4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11568A2A4M2 211 aa4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap9-1Q64526 186 aa4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap4-7Q9D732 168 aa4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A0A1Y7VJH8 109 aa4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4.48□□□□□ -1.69
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A0A1Y7VLE6 161 aa4.29□□□□□ -1.72
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mt3P28184 68 aa4.17□□□□□ -1.74
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11559Q9D3H7 191 aa3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2431E9Q8S1 172 aa3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap5-5Q2TA51 241 aa3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap5-4Q62220 223 aa3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11554B1AQB2 190 aa3.79□□□□□ -1.8
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1110025L11RikO09048 78 aa3.7□□□□□ -1.82
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Muc19Q6PZE0 7524 aa3.57□□□□□ -1.84
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A0A1Y7VJ07 166 aa3.39□□□□□ -1.87
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sprr2bO70554 98 aa3.36□□□□□ -1.87
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10229O08631 77 aa3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa3.25□□□□□ -1.89
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11567Q9D141 195 aa3.11□□□□□ -1.91
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa3.1□□□□□ -1.91
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NebE9Q1W3 7152 aa3.1□□□□□ -1.91
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap21-1Q925H4 128 aa3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phgr1Q8K0G7 91 aa3.05□□□□□ -1.92
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa2.93□□□□□ -1.94
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa2.92□□□□□ -1.94
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa2.9□□□□□ -1.95
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap6-2O08884 159 aa2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krtap5-1Q64507 230 aa1.93□□□□□ -2.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm4559A4IF42 199 aa1.69□□□□□ -2.14
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