RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	COT1	P32798	439 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	BCK2	P33306	851 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	UGA2	P38067	497 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	DAM1	P53267	343 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	RCM1	P53972	490 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	GIS3	Q12418	502 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STB2	YMR053C	CDC26	P14724	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SIR1	P21691	654 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PER1	P25625	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CDC15	P27636	974 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ERV1	P27882	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RSM22	P36056	628 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GLG1	P36143	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SRO77	P38163	1010 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	BSD2	P38356	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RCN2	Q12044	265 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	UBX3	Q12229	455 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SRN2	Q99176	213 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	LAM4	P38800	1345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CBS1	P14066	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	FAR1	P21268	830 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
STB2	YMR053C	GIP1	P38229	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	AIM46	P38885	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SMC3	P47037	1230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HXT16	P47185	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TOM22	P49334	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YNL165W	P53891	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RSN1	Q03516	953 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	IVY1	Q04934	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TLG2	Q08144	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SUA5	P32579	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TCD1	P38756	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	BZZ1	P38822	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ESBP6	P53918	673 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ROY1	Q04847	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ENV7	Q12003	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TGS1	Q12052	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SEC15	P22224	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	AMS1	P22855	1083 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YCK1	P23291	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	BOS1	P25385	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RDS1	P25611	832 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MLF3	P32047	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	REC104	P33323	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MAC1	P35192	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	EXO5	P38289	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	WSS1	P38838	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	EFM3	P47163	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MIG2	P53035	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PPT1	P53043	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	FUS2	Q05670	677 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RAP1	P11938	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SEN2	P16658	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YRO2	P38079	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YBR287W	P38355	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ABM1	P47146	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TAF4	P50105	388 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TIM21	P53220	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RTT103	Q05543	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	EST2	Q06163	884 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CUR1	Q06469	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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