RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 COA7Q96BR5 231 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 SNRKQ9NRH2 765 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 EVI5LQ96CN4 794 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLIM4O00461 696 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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CAPNS1-214ENST00000592483 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 PI16Q6UXB8 463 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 SKAP1Q86WV1 359 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEB2H3BUK9 544 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.44■■■□□ 2.14
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CAPNS1-214ENST00000592483 GUCD1Q96NT3 240 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.143e-6■□□□□ 9
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CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK2Q92608 1830 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 HMGCRP04035 888 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 TCP10Q12799 353 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K12Q12852 859 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 GADL1Q6ZQY3 521 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCF2Q9UG63 623 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 PICK1Q9NRD5 415 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 MAST2Q6P0Q8 1798 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF20L1A8MW92 1017 aa28.39■■■□□ 2.14
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CAPNS1-214ENST00000592483 SDSP20132 328 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 RILPL2Q969X0 211 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 FSD1Q9BTV5 496 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-214ENST00000592483 OGDHLQ9ULD0 1010 aa28.39■■■□□ 2.14
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CAPNS1-214ENST00000592483 HIP1O00291 1037 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 NFIAQ12857 509 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.38■■■□□ 2.13
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLF2Q8IX21 1173 aa28.38■■■□□ 2.13
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CAPNS1-214ENST00000592483 TTC28Q96AY4 2481 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDX5P30044 214 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.36■■■□□ 2.13
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CAPNS1-214ENST00000592483 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 LDHCP07864 332 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 GJD2Q9UKL4 321 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 PFASO15067 1338 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH7P12883 1935 aa28.33■■■□□ 2.13
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CAPNS1-214ENST00000592483 UBE3CQ15386 1083 aa28.33■■■□□ 2.13
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CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRFP10586 1907 aa28.32■■■□□ 2.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 ADD2P35612 726 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 MECOMQ03112 1051 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.32■■■□□ 2.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 FAM161BQ96MY7 647 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 PNMA3Q9UL41 463 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 EYSQ5T1H1 3165 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 USP40Q9NVE5 1235 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM75PA6NK02 468 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 COL6A1P12109 1028 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K10Q02779 954 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-214ENST00000592483 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.3■■■□□ 2.12
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