RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SPAG5Q96R06 1193 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MEGF6O75095 1541 aa8.76□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 OPA1O60313 960 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 C17orf50Q8WW18 174 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 XAGE2Q96GT9 111 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 IRAK1P51617 712 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PIGBQ92521 554 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TSC22D3Q99576 134 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 VCPKMTQ9H867 229 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCB6Q9NP58 842 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 H7C1W4 665 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.019e-7■■■□□ 17.9
EFTUD2-218ENST00000590367 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PALLDQ8WX93 1383 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 BTBD11A6QL63 1104 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 HSPA4P34932 840 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.015e-7■■□□□ 12
EFTUD2-218ENST00000590367 IL17REQ8NFR9 667 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 AKAP12Q02952 1782 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GNPATO15228 680 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PYGBP11216 843 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PDCP20941 246 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CUL3Q13618 768 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CLIC6Q96NY7 704 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SYT17Q9BSW7 474 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PHKG2P15735 406 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TMED1Q13445 227 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ARMC3Q5W041 872 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF15Q8N660 670 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA32Q96LK8 384 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP3K5Q99683 1374 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RGPD5Q99666 1765 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CBFA2T2O43439 604 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM163BP0C2L3 166 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SIK1P57059 783 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 GNGT1P63211 74 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 E2F5Q15329 346 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM7Q9C029 511 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LGR6Q9HBX8 967 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 TCHHQ07283 1943 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CREB3O43889 395 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 PPFIA3O75145 1194 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms