RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 B4E1Z4 1266 aa14.91□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 PDE4BQ07343 736 aa14.91□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 VGLL4Q14135 290 aa14.91□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.91□□□□□ -0.02
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DNMT1-208ENST00000586667 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.91□□□□□ -0.02
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DNMT1-208ENST00000586667 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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DNMT1-208ENST00000586667 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.9□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DNMT1-208ENST00000586667 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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DNMT1-208ENST00000586667 NOVP48745 357 aa14.89□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 KRT32Q14532 448 aa14.89□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.89□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 NT5C2P49902 561 aa14.88□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.88□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.88□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 ASNSP08243 561 aa14.86□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 TSPY3P0CV98 308 aa14.86□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 TSPY8P0CW00 308 aa14.86□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 CHST3Q7LGC8 479 aa14.86□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.86□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.86□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 TTC14Q96N46 770 aa14.86□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.86□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 TNKSO95271 1327 aa14.86□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.85□□□□□ -0.03
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DNMT1-208ENST00000586667 UNCXA6NJT0 531 aa14.85□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 PTPRAP18433 802 aa14.85□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 GJA5P36382 358 aa14.85□□□□□ -0.03
DNMT1-208ENST00000586667 TRDNQ13061 729 aa14.85□□□□□ -0.03
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