RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF213O14771 459 aa29.51■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.51■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 NBPF3Q9H094 633 aa29.51■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 INCENPQ9NQS7 918 aa29.51■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.5■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.5■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 LAMA4Q16363 1823 aa29.5■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 MYH8P13535 1937 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 GH2P01242 217 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 AKR1B1P15121 316 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 PDE4BQ07343 736 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 OPTNQ96CV9 577 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 OTUD5Q96G74 571 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 CAPNS2Q96L46 248 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.49■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.48■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 SLC10A3P09131 477 aa29.48■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 RASA1P20936 1047 aa29.48■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ERO1BQ86YB8 467 aa29.48■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 WNK4Q96J92 1243 aa29.48■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.48■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 REC8O95072 547 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ASNSP08243 561 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 PTPRAP18433 802 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 GJA5P36382 358 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC102AQ96A19 550 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 TOMM22Q9NS69 142 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ECE1P42892 770 aa29.46■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.46■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 SPRYD7Q5W111 196 aa29.46■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 CABP5Q9NP86 173 aa29.46■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 CYP21A2P08686 494 aa29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 VEGFBP49765 207 aa29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC17Q96LX7 622 aa29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 ZHX2Q9Y6X8 837 aa29.45■■■□□ 2.31
RBBP6-211ENST00000568316 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.44■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 GINM1Q9NU53 330 aa29.44■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 PPATQ06203 517 aa29.43■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 SEPT2Q15019 361 aa29.43■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.43■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.43■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 NEDD4P46934 1319 aa29.43■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 USP17L5A8MUK1 530 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 ORC4O43929 436 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 AOC2O75106 756 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 FGRP09769 529 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 GUCY1A2P33402 732 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 PPIL2Q13356 520 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 NECTIN1Q15223 517 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.42■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 IRF6O14896 467 aa29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 SLC27A2O14975 620 aa29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 C8orf34Q49A92 452 aa29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 ZIC5Q96T25 663 aa29.41■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TSPY3P0CV98 308 aa29.4■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TSPY8P0CW00 308 aa29.4■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TFAP4Q01664 338 aa29.4■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 PHIPQ8WWQ0 1821 aa29.39■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TSPY2A6NKD2 308 aa29.39■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 NOGQ13253 232 aa29.39■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.39■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.39■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.39■■■□□ 2.3
RBBP6-211ENST00000568316 TRIM75PA6NK02 468 aa29.38■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 SPP2Q13103 211 aa29.38■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.38■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 B4E1Z4 1266 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 E7EWF7 191 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 ICA1Q05084 483 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 RNF20Q5VTR2 975 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.37■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 ESR2Q92731 530 aa29.36■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 WDR18Q9BV38 432 aa29.36■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.36■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.36■■■□□ 2.29
RBBP6-211ENST00000568316 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms