RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		21.28	■■□□□ 1
RNPS1-222	ENST00000567147	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
RNPS1-222	ENST00000567147	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		21.27	■■□□□ 1
RNPS1-222	ENST00000567147	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
RNPS1-222	ENST00000567147	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		21.27	■■□□□ 1
RNPS1-222	ENST00000567147	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		21.27	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	FLT1	P17948	1338 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM75P	A6NK02	468 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	DOCK1	Q14185	1865 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	PALD1	Q9ULE6	856 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A1W2PPC1	479 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	GOLIM4	O00461	696 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	CAP2	P40123	477 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	IRF5	Q13568	498 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	CERS3	Q8IU89	383 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP5J	P18859	108 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	USP5	P45974	858 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	TREML2	Q5T2D2	321 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	PDE6A	P16499	860 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SPP2	Q13103	211 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147		Q7L0L9	218 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	COA7	Q96BR5	231 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RNPS1-222	ENST00000567147	SYN1	P17600	705 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM32	Q13049	653 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	DCTPP1	Q9H773	170 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	USP17L5	A8MUK1	530 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	HLA-DOA	P06340	250 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	GDF15	Q99988	308 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAJC18	Q9H819	358 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	JAG1	P78504	1218 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	DEFB123	Q8N688	67 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	HAUS7	Q99871	368 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	ASNS	P08243	561 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	GDF11	O95390	407 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	BMP8B	P34820	402 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	TTC6	Q86TZ1	520 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR18	Q9BV38	432 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RNPS1-222	ENST00000567147	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	PLXNB2	O15031	1838 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	HMGCR	P04035	888 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	HMGCS2	P54868	508 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	PNMA3	Q9UL41	463 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	CAPN2	P17655	700 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	ADD2	P35612	726 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RNPS1-222	ENST00000567147	PLCD1	P51178	756 aa		21.13	■□□□□ 0.97

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