RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 GPAA1O43292 621 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MBD4O95243 580 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 BAG3O95817 575 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 GNRH1P01148 92 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 PLCG2P16885 1265 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 GRK4P32298 578 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K9P80192 1104 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 LCORLQ8N3X6 602 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 MYO1BO43795 1136 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 GDF15Q99988 308 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ARMT1Q9H993 441 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 CPA4Q9UI42 421 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 GNAT2P19087 354 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 PSMC4P43686 418 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 KIF22Q14807 665 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 DEFB123Q8N688 67 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 RNF208Q9H0X6 261 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 IRF6O14896 467 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 FOXP2O15409 715 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 GPR153Q6NV75 609 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 IDI2Q9BXS1 227 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ZMYM6O95789 1325 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 MYPNQ86TC9 1320 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 CETPP11597 493 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 PRKCZQ05513 592 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 TEX11Q8IYF3 940 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.1■□□□□ 0.81
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PACS1-208ENST00000529677 USP40Q9NVE5 1235 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 LAMA4Q16363 1823 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 EVI5O60447 810 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 SGPL1O95470 568 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 BMP8BP34820 402 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 MOGSQ13724 837 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ALX1Q15699 326 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 VPS53Q5VIR6 699 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 RAET1EQ8TD07 263 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 GABRQQ9UN88 632 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 PRKAB2O43741 272 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 REC8O95072 547 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 TNFAIP1Q13829 316 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 ERO1BQ86YB8 467 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 CSADQ9Y600 493 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-208ENST00000529677 FLT1P17948 1338 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 MAP4K1Q92918 833 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 BACH2Q9BYV9 841 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 MYH1P12882 1939 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 ENTPD3O75355 529 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 PTH1RQ03431 593 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 NFIAQ12857 509 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 PPIL2Q13356 520 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 SNAPC2Q13487 334 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 FAM83AQ86UY5 434 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-208ENST00000529677 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.06■□□□□ 0.8
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