RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFIBO00712 420 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GIPC1O14908 333 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GDNFP39905 211 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPG7Q9UQ90 795 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L7P0C7H9 530 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAC2P15153 192 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKG7Q16617 165 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 HID1Q8IV36 788 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE2FQ969M7 185 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QTNF9P0C862 333 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP7A1P22680 504 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC6Q86TZ1 520 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIN3Q8TB24 985 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C12orf49Q9H741 205 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM253P0C7T8 217 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRK4P32298 578 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABHD4Q8TB40 342 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK8P49336 464 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 HK2P52789 917 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SV2BQ7L1I2 683 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDH24Q86UP0 819 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNK12Q9HB15 430 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRD1O95696 1058 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAP2P40123 477 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIR3DL1P43629 444 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QL4Q86Z23 238 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYLIPQ8WY64 445 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNK2Q07912 1038 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEPT6Q14141 434 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 LILRA6Q6PI73 481 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 CREG2Q8IUH2 290 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASB16Q96NS5 453 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGRP06401 933 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ETV3P41162 512 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVFC1P60507 584 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP3K11Q16584 847 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNA10Q16322 511 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNN1Q92952 543 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTS10Q9H324 1103 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASH4PA8MWX3 477 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESR1P03372 595 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT1P04264 644 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms