RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL6Q8N841 843 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TNMDQ9H2S6 317 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SLX4Q8IY92 1834 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 BAG3O95817 575 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM29Q14134 588 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 GRIK5Q16478 980 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CERS3Q8IU89 383 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CNKSR1Q969H4 720 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.51□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 PRDM1O75626 825 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 DEXIO95424 95 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.899e-7■■■□□ 16.6
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PDE4D-208ENST00000502484 EVX2Q03828 476 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ADALQ6DHV7 355 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 BCS1LQ9Y276 419 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CLIC4Q9Y696 253 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PQ27 194 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PQ64 194 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PQD8 194 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2D6P10635 497 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 USP5P45974 858 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 STK38Q15208 465 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf60Q5U649 245 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MYH8P13535 1937 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SPTLC2O15270 562 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 DDAH1O94760 285 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 CALM1P0DP23 149 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 GUCY1A2P33402 732 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf229H3BNL8 230 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CTAGE5O15320 804 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MMP1P03956 469 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TYRO3Q06418 890 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FUT2Q10981 343 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 GPR162Q16538 588 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SLF2Q8IX21 1173 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 GAKO14976 1311 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 COA1Q9GZY4 146 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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