RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	GDF11	O95390	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	APP	P05067	770 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	APPBP2	Q92624	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGCS2	P54868	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FCGRT	P55899	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	BACE1	P56817	501 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH7	P12883	1935 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GH2	P01242	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TDO2	P48775	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR2	Q13614	643 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMC4	P43686	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2C8	P10632	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCD1	P51178	756 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	COA7	Q96BR5	231 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L21	D6R901	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	GPAA1	O43292	621 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	NAPB	Q9H115	298 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKAB2	O43741	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE1A	P54750	535 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE4B	Q07343	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	HIP1	O00291	1037 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SHMT1	P34896	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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