RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 NFIAQ12857 509 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 TRDNQ13061 729 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 KRT23Q9C075 422 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 PRKG1Q13976 671 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 RASA3Q14644 834 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 MTA3Q9BTC8 594 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB13Q9UIV8 391 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 ORC4O43929 436 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 CACNB3P54284 484 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K10Q02779 954 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 TCP10Q12799 353 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 NCOA7Q8NI08 942 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 PALD1Q9ULE6 856 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 NAV1Q8NEY1 1877 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-211ENST00000488243 E7EWF7 191 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 FKTNO75072 461 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 NF2P35240 595 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TM4SF4P48230 202 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 GABPAQ06546 454 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CCDC178Q5BJE1 867 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 DCAF15Q66K64 600 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ESR2Q92731 530 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CCDC17Q96LX7 622 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 NEK1Q96PY6 1258 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 GINM1Q9NU53 330 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 PLCD1P51178 756 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 SREBF2Q12772 1141 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 RABEP1Q15276 862 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 MKNK2Q9HBH9 465 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 LAMA4Q16363 1823 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CDK8P49336 464 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 HAND2P61296 217 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 RASEFQ8IZ41 740 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TEPSINQ96N21 525 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 LAMB1P07942 1786 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 MYH1P12882 1939 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 UNCXA6NJT0 531 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CYP2D6P10635 497 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 MCM5P33992 734 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TATDN1Q6P1N9 297 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 FBXL16Q8N461 479 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 NBPF3Q9H094 633 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 FZD1Q9UP38 647 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 POTEFA5A3E0 1075 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD1Q15327 319 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 RUFY3Q7L099 469 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 IQCA1Q86XH1 822 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TMTC2Q8N394 836 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TMEM87BQ96K49 555 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 TRIM17Q9Y577 477 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 ST18O60284 1047 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 CASTP20810 708 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 RASA1P20936 1047 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 RPS6KB1P23443 525 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 MCM2P49736 904 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-211ENST00000488243 SPRYD7Q5W111 196 aa13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms