RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 GABPAQ06546 454 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.054e-29■■■■■ 41.8
C9orf16-202ENST00000486420 CTR9Q6PD62 1173 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 MOB2Q70IA6 237 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 A0A0D9SFI3 127 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 C19orf81C9J6K1 198 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PRKAB2O43741 272 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PTPRAP18433 802 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CHMLP26374 656 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 INPP5BP32019 993 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 USP14P54578 494 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 OTUD5Q96G74 571 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 FAM227BQ96M60 508 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZIC5Q96T25 663 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 WDR18Q9BV38 432 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CDC45O75419 566 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PLCD1P51178 756 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 TSKSQ9UJT2 592 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.73□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF213O14771 459 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CDK8P49336 464 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PPARAQ07869 468 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 DOCK1Q14185 1865 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 SGSM2O43147 1006 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 FGAP02671 866 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 SHMT1P34896 483 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 PNMA3Q9UL41 463 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf16-202ENST00000486420 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 USP17L10C9JJH3 530 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 IRF6O14896 467 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ARHGEF6Q15052 776 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 CCL15Q16663 113 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 DNAJC18Q9H819 358 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ORC4O43929 436 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 CAPN15O75808 1086 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 REC8O95072 547 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 GH2P01242 217 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 CHGBP05060 677 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 BACE1P56817 501 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 TRDNQ13061 729 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 RNF20Q5VTR2 975 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 IFNL1Q8IU54 200 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 FEZ1Q99689 392 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 RNF186Q9NXI6 227 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 FZD1Q9UP38 647 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 FAM196BA6NMK8 535 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 TSPY3P0CV98 308 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 TSPY8P0CW00 308 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 LPAR1Q92633 364 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ESR2Q92731 530 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 KRT23Q9C075 422 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf16-202ENST00000486420 TRPA1O75762 1119 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms