RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457748.1

GTF3C2-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-208ENST00000457748 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 KDM4AO75164 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 FGRP09769 529 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 SLURP2P0DP57 97 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 RASA1P20936 1047 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 MCM5P33992 734 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 FGD1P98174 961 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TFAP4Q01664 338 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 IQCA1Q86XH1 822 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 DNAJC18Q9H819 358 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 PICK1Q9NRD5 415 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 CSADQ9Y600 493 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 SIPA1L1O43166 1804 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ERICH2A1L162 156 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 GDF11O95390 407 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 FKBP1BP68106 108 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 MAP3K9P80192 1104 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 KLRG1Q96E93 195 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 GINM1Q9NU53 330 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ASNSP08243 561 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 AKR1B1P15121 316 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 CAP2P40123 477 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 FZD1Q9UP38 647 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 PRC1O43663 620 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 GH2P01242 217 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 INPP5BP32019 993 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 APLP1P51693 650 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 RPS6KB1P23443 525 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ATP2B2Q01814 1243 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 RABEP1Q15276 862 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 RUFY3Q7L099 469 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 PASKQ96RG2 1323 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-208ENST00000457748 UNCXA6NJT0 531 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 NEK4P51957 841 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 ICA1Q05084 483 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 VGLL4Q14135 290 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 SEPT2Q15019 361 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 MAP3K11Q16584 847 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 MOB2Q70IA6 237 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 CHST3Q7LGC8 479 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 TMEM87BQ96K49 555 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 STX8Q9UNK0 236 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 USP17L5A8MUK1 530 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 ST18O60284 1047 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 TTLL1O95922 423 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 CPA1P15085 419 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 HUNKP57058 714 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 WTAPQ15007 396 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-208ENST00000457748 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms