RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDH23	Q9H251	3354 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCP10	Q12799	353 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	GCKR	Q14397	625 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLA2G5	P39877	138 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	NFIA	Q12857	509 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL6A1	P12109	1028 aa		11.05	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTGDR	Q13258	359 aa		11.05	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.05	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIB2	Q92519	343 aa		11.05	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.05	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTPRF	P10586	1907 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR20E	P86478	221 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR20C	P86479	221 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR20D	P86480	221 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR20B	P86481	221 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR20A	P86496	221 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHH	Q15465	462 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TREML2	Q5T2D2	321 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		11.04	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.03	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.02	□□□□□ -0.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CXCL11	O14625	94 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TLL1	O43897	1013 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMGCR	P04035	888 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYP2B6	P20813	491 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.02	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTPRA	P18433	802 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL14	Q16627	93 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	COA7	Q96BR5	231 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.01	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	LTBP2	Q14767	1821 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOSL2	P15408	326 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP3K12	Q12852	859 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651		F6X3S4	739 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFT57	Q9NWB7	429 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.99	□□□□□ -0.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.99	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms