RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 TREML2Q5T2D2 321 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 CTGFP29279 349 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 GABPAQ06546 454 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 JAG1P78504 1218 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 MTMR2Q13614 643 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-201ENST00000370002 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 PLCD1P51178 756 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 BCL11AQ9H165 835 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 CABP5Q9NP86 173 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 FOCADQ5VW36 1801 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 GDF11O95390 407 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 GH2P01242 217 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 USP14P54578 494 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 LCORLQ8N3X6 602 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 C12orf42Q96LP6 360 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 SWAP70Q9UH65 585 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 MYPNQ86TC9 1320 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 RAET1EQ8TD07 263 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 SHMT1P34896 483 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 SIPA1L1O43166 1804 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 ERC2O15083 957 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 MBD4O95243 580 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 GRK4P32298 578 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 IRF5Q13568 498 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 ARMT1Q9H993 441 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 CAPN2P17655 700 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 COA7Q96BR5 231 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX3-201ENST00000370002 POTEFA5A3E0 1075 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 PRKCZQ05513 592 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 GCC1Q96CN9 775 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 CCDC17Q96LX7 622 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 UBXN2AP68543 259 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 C12orf60Q5U649 245 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 PTPRFP10586 1907 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 CENPFP49454 3210 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 FLT3LGP49771 235 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 HERVK_113P62684 666 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 FEZ1Q99689 392 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L15C9J2P7 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L11C9JVI0 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L18D6R9N7 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L22D6RA61 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L19D6RCP7 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L20D6RJB6 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 PRKAB2O43741 272 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 USP17L24Q0WX57 530 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 APPBP2Q92624 585 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 GNAT2P19087 354 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 GUCY1A2P33402 732 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX3-201ENST00000370002 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms