RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 SLURP2P0DP57 97 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 DNAJC18Q9H819 358 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 ERICH2A1L162 156 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TSPY3P0CV98 308 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TSPY8P0CW00 308 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 SHMT1P34896 483 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TMX3Q96JJ7 454 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 FAM196BA6NMK8 535 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 POTECB2RU33 542 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TEPSINQ96N21 525 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 APOBRQ0VD83 1088 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TNKSO95271 1327 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 LIFRP42702 1097 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 WTAPQ15007 396 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 LY9Q9HBG7 655 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D12O60347 775 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 TMTC2Q8N394 836 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 CCDC17Q96LX7 622 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.01■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 NMT2O60551 498 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SEC23AQ15436 765 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 ME3Q16798 604 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 LARGE1O95461 756 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 AKR1B1P15121 316 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 EVCP57679 992 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SENP2Q9HC62 589 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 CCDC69A6NI79 296 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K10Q02779 954 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SULF1Q8IWU6 871 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 RRAGCQ9HB90 399 aa25.98■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.97■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 STK3Q13188 491 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 DGKHQ86XP1 1220 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 MYH4Q9Y623 1939 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 CUL4AQ13619 759 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 HOOK2Q96ED9 719 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.96■■□□□ 1.75
CTU2-201ENST00000312060 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 NECAB1Q8N987 351 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CEP95Q96GE4 821 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 GDF11O95390 407 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 APOA5Q6Q788 366 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ANKS1AQ92625 1134 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 STX8Q9UNK0 236 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 PFKFB2O60825 505 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 DCAF15Q66K64 600 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms