RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 PAK2Q13177 524 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 LIN9Q5TKA1 542 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 NELFBQ8WX92 580 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 GNPATO15228 680 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB9Q96C00 473 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 A1BGP04217 495 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 FLOT1O75955 427 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf37Q96NL8 207 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 POTEDQ86YR6 584 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 USP44Q9H0E7 712 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 PPFIA1Q13136 1202 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP157Q5JU67 520 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 DNM3Q9UQ16 869 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS12P58397 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 CABP7Q86V35 215 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 GGA1Q9UJY5 639 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-201ENST00000284617 GBP6Q6ZN66 633 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC169A6NNP5 214 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CEP104O60308 925 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CALCRLQ16602 461 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 DAAM2Q86T65 1068 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 BTG4Q9NY30 223 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP2AO43633 222 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SP4Q02446 784 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 BEND3Q5T5X7 828 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR6Q9Y217 621 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC160A6NGH7 325 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PFKFB2O60825 505 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PFKFB1P16118 471 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KA1Q15418 735 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TAF5LO75529 589 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5BP32019 993 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 FYB2Q5VWT5 728 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR3Q13615 1198 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNC1O60486 1568 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 STMN2Q93045 179 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A4P43007 532 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC4P43686 418 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PNOCQ13519 176 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 BRD3Q15059 726 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 DYMQ7RTS9 669 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 GNA14O95837 355 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 BCRP11274 1271 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP25P42331 645 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 USP28Q96RU2 1077 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 KDRP35968 1356 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms