RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 CYP2D6P10635 497 aa22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 FUT2Q10981 343 aa22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 TIGD1Q96MW7 591 aa22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 SARM1Q6SZW1 724 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 CUTAO60888 179 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 DDAH1O94760 285 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 SERPINB2P05120 415 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 SYKP43405 635 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 ST5P78524 1137 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 RESP18Q5W5W9 173 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.73■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 GPSM2P81274 684 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 PKN1Q16512 942 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 CLIC6Q96NY7 704 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 PDE4BQ07343 736 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 NR5A1Q13285 461 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 SHISA4Q96DD7 197 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.72■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.71■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 BECN2A8MW95 431 aa22.71■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 NMT2O60551 498 aa22.71■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.71■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 OXER1Q8TDS5 423 aa22.7■■□□□ 1.23
RTKN-201ENST00000233330 USP17L8P0C7I0 530 aa22.7■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 GRIK5Q16478 980 aa22.7■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.7■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.7■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 XBP1P17861 261 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CDC25BP30305 580 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 GSTO1P78417 241 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 FBXW7Q969H0 707 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.69■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 TSPY2A6NKD2 308 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 UFL1O94874 794 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 PTGS1P23219 599 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 ATP2B4P23634 1241 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 USP5P45974 858 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 C12orf60Q5U649 245 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 DRC7Q8IY82 874 aa22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 NLRP12P59046 1061 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 PPP4CP60510 307 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CD209Q9NNX6 404 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 BAG3O95817 575 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 DDR1Q08345 913 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 GGA1Q9UJY5 639 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.67■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 TRIM37O94972 964 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 PTPREP23469 700 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 LTBP1Q14766 1721 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 IL1R1P14778 569 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 NT5C2P49902 561 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 CABP5Q9NP86 173 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.66■■□□□ 1.22
RTKN-201ENST00000233330 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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