RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.58■□□□□ 0.89
SPCS1-201ENST00000233025 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 MSCO60682 206 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A1P13866 664 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-9P63128 1117 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-24P63145 666 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 PICALMQ13492 652 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 POLA2Q14181 598 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 Q3C1V9 767 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 THEGQ9P2T0 379 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJB2P25686 324 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 LPIN2Q92539 896 aa20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L5A8MUK1 530 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 CAP2P40123 477 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 MAP2K5Q13163 448 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 MTMR2Q13614 643 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC27Q2M243 656 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM60Q495X7 471 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.55■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 IL16Q14005 1332 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 EPHB4P54760 987 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 WWC1Q8IX03 1113 aa20.54■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 BACE1P56817 501 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 TRPV1Q8NER1 839 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 WDR18Q9BV38 432 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF576Q9H609 170 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 GBF1Q92538 1859 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.53■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 ITGB8P26012 769 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 BTDP43251 543 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 RHBDL3P58872 404 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.52■□□□□ 0.88
SPCS1-201ENST00000233025 IGHA2P01877 340 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.51■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 FOCADQ5VW36 1801 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA3EO15041 775 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 CYBAP13498 195 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 CNGA1P29973 690 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1EQ8WY54 764 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.5■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 EYA2O00167 538 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC6P09630 235 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TIFAQ96CG3 184 aa20.49■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 KBTBD13C9JR72 458 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2C19P33261 490 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 PHKA1P46020 1223 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.48■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TRANK1O15050 2925 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 CNMDO75829 334 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 SLF2Q8IX21 1173 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.47■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf81C9J6K1 198 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 JAG1P78504 1218 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 TLE2Q04725 743 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2B3Q16720 1220 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF384Q8TF68 577 aa20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPCS1-201ENST00000233025 PTPREP23469 700 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms