RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 MYH8P13535 1937 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 PRKG1Q13976 671 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 GDF11O95390 407 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 AKR1B1P15121 316 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TNNI2P48788 182 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 USP48Q86UV5 1035 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 LARGE1O95461 756 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 MCM5P33992 734 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 KRT23Q9C075 422 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TSPY2A6NKD2 308 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 ORC4O43929 436 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TRAK2O60296 914 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TNFAIP1Q13829 316 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 ESR2Q92731 530 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 BRF1Q92994 677 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 APOBRQ0VD83 1088 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 FGD1P98174 961 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 EHD4Q9H223 541 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 ST18O60284 1047 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TSPY3P0CV98 308 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TSPY8P0CW00 308 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 STK3Q13188 491 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 FSD2A1L4K1 749 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TRAF5O00463 557 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 SULF1Q8IWU6 871 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 MYL10Q9BUA6 226 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TNKSO95271 1327 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 RXRAP19793 462 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 NECAB1Q8N987 351 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 LY9Q9HBG7 655 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 MOB2Q70IA6 237 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 GBP4Q96PP9 640 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 SWAP70Q9UH65 585 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 MTMR7Q9Y216 660 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 PPFIA3O75145 1194 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 SEC23AQ15436 765 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 ME3Q16798 604 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 CEP95Q96GE4 821 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 GH2P01242 217 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 PTMSP20962 102 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 INPP5BP32019 993 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 GUCY1A2P33402 732 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT1-201ENST00000211413 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 SEPT2Q15019 361 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 TMX3Q96JJ7 454 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.82■■□□□ 1.08
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