RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.24□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 BEND3Q5T5X7 828 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SCYL1Q96KG9 808 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 ARHGAP6O43182 974 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 EXOC7Q9UPT5 735 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 FANCCQ00597 558 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 BIRC2Q13490 618 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PPP2R5EQ16537 467 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 VPS16Q9H269 839 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 VEZTQ9HBM0 779 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 TTC4O95801 387 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 BCRP11274 1271 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 USTQ9Y2C2 406 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PDE1AP54750 535 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 APOBRQ0VD83 1088 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CCDC184Q52MB2 194 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.23□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SCINQ9Y6U3 715 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PICALMQ13492 652 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 ESYT2A0FGR8 921 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 STRN3Q13033 797 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 KRT81Q14533 505 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SMC5Q8IY18 1101 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 KCNH3Q9ULD8 1083 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CASP2P42575 452 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SP4Q02446 784 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 FCHSD1Q86WN1 690 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 AK2P54819 239 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 HAUS3Q68CZ6 603 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PALM2Q8IXS6 379 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CCDC169A6NNP5 214 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CHMP2AO43633 222 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CHST3Q7LGC8 479 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SUN1O94901 812 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 FBXO41Q8TF61 875 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 CUL7Q14999 1698 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 STK24Q9Y6E0 443 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS1-201ENST00000171887 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 IQCDQ96DY2 449 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 MBIPQ9NS73 344 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 SCOCQ9UIL1 159 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 KRIT1O00522 736 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 IWS1Q96ST2 819 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 ZNF174Q15697 407 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 IL16Q14005 1332 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 IGHDP01880 384 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 C16orf87Q6PH81 154 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 HAUS1Q96CS2 278 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 PALMDQ9NP74 551 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 AMFRQ9UKV5 643 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 NELFBQ8WX92 580 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 TXLNGQ9NUQ3 528 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 KIF11P52732 1056 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 PDE4DQ08499 809 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 OGFOD1Q8N543 542 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS1-201ENST00000171887 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms