RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	USP17L21	D6R901	530 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	C6orf229	H3BNL8	230 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GNAQ	P50148	359 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GPSM2	P81274	684 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ADAL	Q6DHV7	355 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CTR9	Q6PD62	1173 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	SMIM5	Q71RC9	77 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	PANK2	Q9BZ23	570 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	COA1	Q9GZY4	146 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CD209	Q9NNX6	404 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DACT1	Q9NYF0	836 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		9.63	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	SPTLC2	O15270	562 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	BMP15	O95972	392 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TPM3	P06753	285 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	PRDX5	P30044	214 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FOSB	P53539	338 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GUCY1B3	Q02153	619 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	KRT40	Q6A162	431 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MASTL	Q96GX5	879 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	USP28	Q96RU2	1077 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MAP3K14	Q99558	947 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	KAT14	Q9H8E8	782 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MYH6	P13533	1939 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	PPP6R2	O75170	966 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	KLRK1	P26718	216 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TPM4	P67936	248 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	NTRK3	Q16288	839 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ANO1	Q5XXA6	986 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DGKH	Q86XP1	1220 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MPND	Q8N594	471 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	AKT1S1	Q96B36	256 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	9.61	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501		H0YIN7	160 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MMP1	P03956	469 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TSPY3	P0CV98	308 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	TSPY8	P0CW00	308 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	CDC27	P30260	824 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DDR1	Q08345	913 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	SLC39A14	Q15043	492 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	SEC23A	Q15436	765 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	STX1A	Q16623	288 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	C12orf60	Q5U649	245 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PNKP-231	ENST00000640501	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87

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