RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP1CQ5VVH2 108 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 GPC2Q8N158 579 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 INCENPQ9NQS7 918 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO1BO43795 1136 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCD1P51178 756 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf86Q6ZW13 317 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST3Q7LGC8 479 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP4CQ96CF2 233 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC2Q9BYS8 371 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF541Q9H0D2 1346 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DOAP06340 250 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOZ2Q9NPC6 264 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 GJA3Q9Y6H8 435 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SIPA1L1O43166 1804 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 LIFRP42702 1097 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 NFIAQ12857 509 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ME3Q16798 604 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ERICH2A1L162 156 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM22K7EJ46 135 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIN3BO60391 1043 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE2Q495Y8 402 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCA1Q86XH1 822 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 TMTC2Q8N394 836 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 EHD4Q9H223 541 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM198AQ9UFP1 575 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 STK11IPQ8N1F8 1099 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MKNK2Q9HBH9 465 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ATRNL1Q5VV63 1379 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 UBAC1Q9BSL1 405 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF181Q9P0P0 153 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SWAP70Q9UH65 585 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR162Q16538 588 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SGMS1Q86VZ5 419 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 EVX2Q03828 476 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GABPAQ06546 454 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC178Q5BJE1 867 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM67Q5HYA8 995 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB13Q9UIV8 391 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT10BO00744 389 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LARGE1O95461 756 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK8P49336 464 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBRQ0VD83 1088 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MICALL2Q8IY33 904 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX2-3Q8TAU0 364 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNLL2Q96FJ2 89 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM1O75626 825 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PI4KBQ9UBF8 816 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C1D1 291 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PFKFB2O60825 505 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNB3P54284 484 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM83AQ86UY5 434 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LY9Q9HBG7 655 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPY2A6NKD2 308 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 WTAPQ15007 396 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF3C6Q969F1 213 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 DDIT3P35638 169 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM151AQ8WW52 585 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TCP10Q12799 353 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRC5DQ9NZD1 345 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TNKSO95271 1327 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RASA1P20936 1047 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RCAN1P53805 252 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC23AQ15436 765 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC83Q8IWF9 413 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CLRN2A0PK11 232 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC69A6NI79 296 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPY3P0CV98 308 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPY8P0CW00 308 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TNNI2P48788 182 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TFAP4Q01664 338 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFAIP1Q13829 316 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
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